Bonnefontaine est une commune du département du Jura, dans la région de Bourgogne-Franche-Comté.
Bonnefontaine fait partie du canton de Poligny
Bonnefontaine adhère à la la communauté de communes Bresse Haute Seille
Bonnefontaine fait partie du bassin de vie de
580 m.
La population de Bonnefontaine est de 104 habitants (2020)
Le code postal de de Bonnefontaine est : 39800